Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms