Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itgb8Q0VBD0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms