Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms