Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Tgm3Q08189 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tgm3Q08189 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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