Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
F13bQ07968 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms