Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Siah1bQ06985 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms