Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Msx2Q03358 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms