Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms