Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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NfiaQ02780 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NfiaQ02780 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms