Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ascl1Q02067 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms