Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms