Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms