Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp1Q00915 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbp1Q00915 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms