Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Col8a1Q00780 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms