Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms