Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cited1P97769 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cited1P97769 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms