Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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