Protein–RNA interactions for Protein: P84444

Ccl21a, C-C motif chemokine 21a, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21aP84444 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl21aP84444 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl21aP84444 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl21aP84444 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl21aP84444 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl21aP84444 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21aP84444 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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