Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
H3f3aP84244 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H3f3aP84244 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms