Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irx3P81067 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx3P81067 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms