Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad50P70388 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad50P70388 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms