Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NficP70255 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NficP70255 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NficP70255 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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