Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms