Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vamp3P63024 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp3P63024 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms