Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rps3P62908 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rps3P62908 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms