Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Arf6P62331 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Arf6P62331 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms