Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lsm5P62322 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms