Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rps11P62281 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms