Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lmo4P61969 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lmo4P61969 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms