Protein–RNA interactions for Protein: P61025

Cks1b, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks1bP61025 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cks1bP61025 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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