Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snap25P60879 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms