Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csrnp3P59055 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms