Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
P58686 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P58686 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P58686 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms