Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Paxbp1P58501 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Paxbp1P58501 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Paxbp1P58501 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms