Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rrp1P56183 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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