Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2e3P52483 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms