Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pa2g4P50580 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pa2g4P50580 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms