Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ercc3P49135 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ercc3P49135 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms