Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms