Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SrprbP47758 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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