Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax9P47242 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pax9P47242 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms