Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nedd4P46935 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nedd4P46935 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms