Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cdkn1bP46414 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms