Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gdf5P43027 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gdf5P43027 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms