Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nkx1-2P42580 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms