Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
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Rpl28P41105 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpl28P41105 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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