Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PpargP37238 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PpargP37238 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms