Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddit3P35639 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms