Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prim2P33610 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms