Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nedd1P33215 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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